reaction kinetics ;
hydrophobic effect and electrostatics;
and the development of new methods for the characterization of biomolecules and their assemblies using statistical mechanics and molecular simulation.
www.biophys.mpg.deReaktionskinetik ;
hydrophobe Effekte und Elektrostatik;
sowie die Entwicklung neuer Methoden zur Beschreibung von Biomolekülen und biomolekularen Komplexen und Aggregaten basierend auf Statistischer Mechanik und molekularer Simulation.
www.biophys.mpg.deTo substantially speed up Molecular Dynamics simulations of systems with large numbers of particles, we devise novel algorithms that are optimally suited for Graphic Processing Units ( GPUs ).
Our main target are computationally intensive interactions, namely hydrodynamics and electrostatics, which are by far the most expensive algorithms.
These algorithms we will extend to scale efficiently on massively parallel architectures (for example, GPUs).
www.sfb716.uni-stuttgart.deDazu werden effiziente Methoden für Systeme mit großen Teilchenzahlen, insbesondere Gra kkarten ( GPU ) -gestützte Algorithmen entwickelt.
Besonderes Augenmerk gilt dabei den rechenzeitintensivsten Wechselwirkungen, die in diesen Molekulardynamik-Simulationen eingesetzt werden, nämlich Hydrodynamik und Elektrostatik.
Diese sollen so weiterentwickelt werden, dass sie auf massiv-parallelen Architekturen (z.B. GPUs) effizient skalieren.
www.sfb716.uni-stuttgart.deOur extensive experience in various fields of application allows fast time-to-solutions for related tasks.
Experiences in the field of specific coupled physical domains (electrostatics /structural dynamics).
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www.ipms.fraunhofer.deUnsere umfangreiche Erfahrungen auf vielfältigen Einsatzgebieten ermöglicht kurze Lösungszeiten für verwandte Aufgabenstellungen.
Erfahrungen auf dem Gebiet spezieller gekoppelter physikalischer Domänen (Elektrostatik/Strukturdynamik).
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