-E . ..
Each of these domains consists of an alpha-helix.
The alpha-helices are connected by non-helical DNA.
www.biologie.uni-hamburg.de-E . ..
In jedem dieser Abschnitte ( Domänen ) ist die Polypeptidkette zu einer alpha-Helix gewunden.
Die alpha-Helices sind durch nichthelicale Abschnitte miteinander verbunden.
www.biologie.uni-hamburg.deMain features of these domains are sixstranded antiparallel beta-barrels the axes of which are set at about 90 ° at each other.
Additionally, there are an alpha-helix and some stretches of 310-helices as well.
The beta-barrels deviate somewhat from an ideal structure.
www.biologie.uni-hamburg.deDie Hauptmerkmale dieser Domänen sind sechssträngige antiparallele beta-Fässer, deren Achsen etwa 90 ° gegeneinander gedreht sind.
Außerdem gibt es eine alpha-Helix und einige Stücke von 310-Helices.
Die beta-Fässer weichen etwas von einer idealen Struktur ab.
www.biologie.uni-hamburg.deHydrogen bonds are formed from the hydroxyl group to Asn207 and Tyr228 and from the pyridine nitrogen to Asp225.
The phosphate group is faced by the positively charged dipole-end of an alpha-helix and the guanidino group of Arg259.
Additionally there are hydrogen bonds to Thr133, Thr248, Ser250, and Tyr92 ( the latter being from the other subunit ).
www.biologie.uni-hamburg.deAußer durch diese kovalente Bindung wird er durch zahlreiche andere Wechselwirkungen positioniert : der Pyridinring liegt zwischen Tyr165 und der Seitenkette von Val227 mit pi-Elektronen-Wechselwirkung. Wasserstoffbrücken werden von den Hydroxylgruppen zu Asn207 und Tyr228 gebildet sowie vom Pyridin-Stickstoff zu Asp225.
Die Phosphatgruppe liegt gegenüber dem positiv geladenen Dipolende einer alpha-Helix und der Guanidinogruppe von Arg259.
Zusätzlich gibt es Wasserstoffbrücken zu Thr133, Thr248, Ser250, und Tyr92 ( letzteres aus der anderen Untereinheit ).
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